MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 1294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	AAT	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621571
2	NC_008564	TTG	2	6	827	832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621571
3	NC_008564	CCT	2	6	845	850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621571
4	NC_008564	CAA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
5	NC_008564	GAA	2	6	903	908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621571
6	NC_008564	ATC	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
7	NC_008564	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
8	NC_008564	TTA	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621571
9	NC_008564	CTC	2	6	1052	1057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621571
10	NC_008564	T	6	6	1119	1124	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
11	NC_008564	AT	3	6	1152	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	117621571
12	NC_008564	CAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
13	NC_008564	TCA	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
14	NC_008564	CAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
15	NC_008564	TCA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
16	NC_008564	ACT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
17	NC_008564	A	7	7	1244	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	117621571
18	NC_008564	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
19	NC_008564	CCAA	2	8	1320	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	117621571
20	NC_008564	ATATA	2	10	1696	1705	60 %	40 %	0 %	0 %	117621572
21	NC_008564	TTGT	2	8	1715	1722	0 %	75 %	25 %	0 %	117621572
22	NC_008564	A	7	7	1790	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
23	NC_008564	A	6	6	1811	1816	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
24	NC_008564	AGA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
25	NC_008564	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
26	NC_008564	AGA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
27	NC_008564	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
28	NC_008564	TGA	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621572
29	NC_008564	A	6	6	1918	1923	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
30	NC_008564	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
31	NC_008564	A	8	8	1962	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
32	NC_008564	AGA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
33	NC_008564	TCA	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621572
34	NC_008564	AAAC	2	8	2084	2091	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
35	NC_008564	ATA	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621572
36	NC_008564	GTA	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621572
37	NC_008564	AAAC	2	8	2159	2166	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
38	NC_008564	GCT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621572
39	NC_008564	GAC	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621572
40	NC_008564	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
41	NC_008564	TTG	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621572
42	NC_008564	ATT	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621572
43	NC_008564	TTA	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621572
44	NC_008564	AAG	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
45	NC_008564	TACAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	0 %	20 %	117621572
46	NC_008564	TA	3	6	2793	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	117621573
47	NC_008564	GTA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621573
48	NC_008564	GAAA	2	8	2874	2881	75 %	0 %	25 %	0 %	117621573
49	NC_008564	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	117621573
50	NC_008564	T	6	6	2910	2915	0 %	100 %	0 %	0 %	117621573
51	NC_008564	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621573
52	NC_008564	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
53	NC_008564	CA	3	6	3278	3283	50 %	0 %	0 %	50 %	117621574
54	NC_008564	TAA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621574
55	NC_008564	GAGAAA	2	12	3333	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621574
56	NC_008564	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
57	NC_008564	ATTT	2	8	3373	3380	25 %	75 %	0 %	0 %	117621574
58	NC_008564	AAG	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621574
59	NC_008564	TGG	3	9	3422	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621574
60	NC_008564	ATTTA	2	10	3443	3452	40 %	60 %	0 %	0 %	117621574
61	NC_008564	ATT	2	6	3480	3485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
62	NC_008564	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
63	NC_008564	A	7	7	3615	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
64	NC_008564	A	7	7	3693	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
65	NC_008564	TTA	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
66	NC_008564	A	7	7	3952	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	117621575
67	NC_008564	ATT	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621575
68	NC_008564	ACAA	2	8	4000	4007	75 %	0 %	0 %	25 %	117621575
69	NC_008564	AAT	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621575
70	NC_008564	GGA	2	6	4038	4043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621575
71	NC_008564	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621575
72	NC_008564	GAATT	2	10	4091	4100	40 %	40 %	20 %	0 %	117621575
73	NC_008564	ACA	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621575
74	NC_008564	TAA	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621575
75	NC_008564	AAATT	2	10	4135	4144	60 %	40 %	0 %	0 %	117621575
76	NC_008564	TTA	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621575
77	NC_008564	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621575
78	NC_008564	AGA	2	6	4296	4301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621575
79	NC_008564	A	6	6	4345	4350	100 %	0 %	0 %	0 %	117621575
80	NC_008564	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621575
81	NC_008564	TAA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621575
82	NC_008564	AAT	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621575
83	NC_008564	T	6	6	4579	4584	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
84	NC_008564	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621576
85	NC_008564	T	7	7	4607	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
86	NC_008564	ATT	2	6	4725	4730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621576
87	NC_008564	C	6	6	4846	4851	0 %	0 %	0 %	100 %	117621576
88	NC_008564	TTA	2	6	4886	4891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621576
89	NC_008564	TAG	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621576
90	NC_008564	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621576
91	NC_008564	GCATA	2	10	4955	4964	40 %	20 %	20 %	20 %	117621576
92	NC_008564	TCA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621576
93	NC_008564	CA	3	6	5048	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	117621576
94	NC_008564	TAAT	2	8	5146	5153	50 %	50 %	0 %	0 %	117621576
95	NC_008564	ATTT	2	8	5156	5163	25 %	75 %	0 %	0 %	117621576
96	NC_008564	ATC	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621576
97	NC_008564	T	6	6	5261	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
98	NC_008564	ATT	2	6	5328	5333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621576
99	NC_008564	AAC	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621576
100	NC_008564	ACG	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621576
101	NC_008564	CTA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
102	NC_008564	TA	3	6	5533	5538	50 %	50 %	0 %	0 %	117621577
103	NC_008564	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
104	NC_008564	TAA	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621577
105	NC_008564	TCT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621577
106	NC_008564	TAAA	2	8	5778	5785	75 %	25 %	0 %	0 %	117621577
107	NC_008564	TCA	2	6	5786	5791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
108	NC_008564	TAA	2	6	5818	5823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621577
109	NC_008564	CGTCT	2	10	5842	5851	0 %	40 %	20 %	40 %	117621577
110	NC_008564	GTA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621577
111	NC_008564	T	6	6	5921	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
112	NC_008564	AAG	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621577
113	NC_008564	CTA	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
114	NC_008564	TTG	2	6	5959	5964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621577
115	NC_008564	T	6	6	5973	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
116	NC_008564	CAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621577
117	NC_008564	TTG	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621577
118	NC_008564	AG	3	6	6060	6065	50 %	0 %	50 %	0 %	117621577
119	NC_008564	TCT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621577
120	NC_008564	TCAA	2	8	6104	6111	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
121	NC_008564	AGA	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621577
122	NC_008564	ATCA	2	8	6166	6173	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
123	NC_008564	TCA	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
124	NC_008564	CCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621577
125	NC_008564	TCA	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
126	NC_008564	ATC	2	6	6337	6342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621577
127	NC_008564	GAA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621577
128	NC_008564	T	6	6	6405	6410	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
129	NC_008564	ATT	2	6	6433	6438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621577
130	NC_008564	T	8	8	6539	6546	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
131	NC_008564	T	8	8	6604	6611	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
132	NC_008564	TCT	3	9	6659	6667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621577
133	NC_008564	TAA	2	6	6687	6692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621577
134	NC_008564	TAA	3	9	6705	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621577
135	NC_008564	TAAAT	2	10	6735	6744	60 %	40 %	0 %	0 %	117621577
136	NC_008564	ATT	2	6	6966	6971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621578
137	NC_008564	ATAA	2	8	6996	7003	75 %	25 %	0 %	0 %	117621578
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